โรคและความผิดปกติของเป็ดเนื้อ มีหลายคำถามจากผู้เลี้ยงเป็ดเนื้อถึงอาการผิดปกติหลายอย่างในเป็ดเนื้อ โดยเฉพาะเมื่อเลี้ยงเป็ดเนื้อลักษณะฝูง อาการผิดปกติที่พบเห็นบ่อย ได้แก่
1. อาการขาอ่อน ยืนทรงตัวไม่ได้ มักพบในช่วง 2-3 สัปดาห์แรก ส่วนใหญ่เป็นในพันธุ์เป็ดที่มีอัตราการแลกเนื้อสูงจะเจริญเติบโตเร็ว แต่จะมีอาการขาอ่อนนั่งบนข้อขา หรือเมื่อเป็ดพยายามลุกเดินจะหงายท้องเท้าตะกุยอากาศ อาจได้รับเชื้อโรคอื่นเข้าแทรก เช่น Duck plague หรือ New duck Ayndrome การแก้ไขควรมีการจัดการเรื่องอาหารและปริมาณสารอาหารให้เหมาะสม รวมทั้งการกกลูกเป็ดให้ทั่วถึง ซึ่งเป็นปัจจัยเกี่ยวข้องกับภาวะอาการด้วย
2. ตาอักเสบ อาการที่พบคือ เยื่อตาขาวจะมีอาการแดง หรือมีสีชมพูจัด น้ำตาไหล ตาเปียกแฉะตลอดเวลา เป็ดมักจาม หรือมีน้ำมูกไหลด้วย สาเหตุมักเกิดจากโรงเรือนชื้นแฉะ ปริมาณแอมโมเนียในโรงเรือนมีสูงก่อให้เกิดการระคายเคือง ควรเปลี่ยนที่ปูนอน หรือเลี้ยงจำนวนเป็ดให้เหมาะสมกับโรงเรือน